La actividad de investigación tiene definida dos líneas esenciales de investigación, entre las que existen importantes áreas de interconexión.
La primera está centrada en el estudio de los procesos de internacionalización de las economías en general y de las empresa en general, la segunda está especializada en las finanzas tanto de mercado como corporativas, con un especial énfasis en el análisis de la banca.

Con respecto a la primera de la línea de investigación el Centro Internacional Carlos V participa activamente en la dirección de tesis doctorales , realización de proyectos de i nvestigaciones, edición de papeles de trabajo y coordinación de colecciones editoriales relacionadas con las siguientes áreas de interés:

• Inversión directa y desarrollo económico
• Eficiencia del apoyo institucional a la internacionalización de la empresa
• Multinacionalización y generación de valor.

El área financiera del Carlos V orienta su investigación en tres líneas principales:
• Aplicación de la teoría de opciones reales a la solución de problemas de finanzas corporativas. En este sentido se han publicado varios trabajos sobre la valoración de empresas de alta tecnología en base a modelos de valoración de opciones de crecimiento.
• Valoración y análisis de los efectos de la utilización de derivados.
• Modelos de evaluación de riesgo soberano y su inclusión en la medición del riesgo global de las entidades bancarias.